Bioévaluation des écosystèmes et expertise de la biodiversité (BEEB)

Parcours M2

Université Lyon 1

Contacts

Informations de contact pour ce parcours publiées sans données personnelles (coordonnées protégées).

Université Claude Bernard Lyon 1

Laboratoire d’Écologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés
UMR 5023

Lieu non affiché publiquement

Préambule

Le M2 parcours BEEB « Bioévaluation des Ecosystèmes et Expertise de la Biodiversité » a accueilli sa première promotion d’étudiants dans sa nouvelle version à la rentrée 2016. Vous trouverez ci-dessous toutes les informations nécessaires pour découvrir la nouvelle offre de formation, son fonctionnement, les modalités d’inscription et les débouchés.

Objectifs de la formation

Les activités visées par ce diplôme concernent des ingénieurs conseillers en environnement et spécialisés dans la gestion des espaces protégés et plus particulièrement la mise en œuvre des directives européennes (« Cadre sur l’eau », « Habitat », « Oiseaux ») dans une approche pluridisciplinaire mêlant les sciences écologiques et les sciences humaines. Elles impliquent des missions de conception, conseil et suivi de projets, de mise en œuvre d’actions de gestion et de conservation des espaces naturels, périurbains et urbains à haute valeur patrimoniale, tant sur le plan juridique que scientifique. Ce parcours vise à former des professionnels susceptibles de s’intégrer dans le processus de mise en place des politiques de développement durable en France et en Europe. Le champ d’action couvre :

  • la prévision des impacts d’aménagement et la définition de zones à protéger,
  • l’évaluation de l’efficacité des mesures de protection et de restauration,
  • l’intégration des critères socio-économiques et du cadre juridique dans les actions conservatoires,
  • la coordination des études d’impact ou des projets liés au développement durable.

La formation BEEB s’appuie sur le M2 EEG en termes d’équipe pédagogique et bénéficie de partenaires en gestion de l’environnement et des collectivités locales. Ces partenaires jouent un rôle majeur dans l’offre de stage et le recrutement des étudiants.

Compétences et savoir-faire visés à l’issue de la formation

  • Capacité de synthèse
  • Démarche intégrative
  • Restitution de résultats scientifiques (oral et écrit)
  • Conduite de projet et établissement de cahier des charges
  • Gestion de l’interface entre scientifiques et gestionnaires
  • Constitution de dossiers techniques
  • Travail en équipe

Originalités et force de la formation M2 BEEB

  • Contribution des équipes de recherche impliquées dans la bioévaluation, la gestion et la restauration des écosystèmes, ainsi que l’analyse de la biodiversité
  • Pluridisciplinarité assurée par des spécialistes du droit de l’environnement et de la socio-économie
  • Réseau de professionnels de l’environnement, services publics et conservatoires impliqué dans des projets NATURA 2000

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Contenu pédagogique et organisation des cours

Semestre 1 (S3)

Conférences interdisciplinaires sur des thématiques actuelles de gestion environnementale (conservation, restauration, connectivité) permettant de combiner les compétences en écologie et méthodologie et d’apprécier les apports de la pluridisciplinarité (UE AIEE – transfert à l’application).

Deux UEs dédiées à l’insertion professionnelle, partagées avec le M2 EEG, sont proposées (Communication scientifique et Anglais).

L’UE Projet tuteuré permet de mener un projet commandé par un prestataire dans son intégralité, simulant une véritable situation professionnelle.

Le choix d’une UE optionnelle complète la formation. L’UE SIG est fortement recommandée compte tenu de la vocation professionnalisante du parcours. D’autres UEs comme Biodiversité et Fonctionnement des Ecosystèmes ou Modèles Statistiques pour la Biologie sont également possibles.

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Trajectoires Evolutives

  • Modèles statistiques pour la Biologie
  • Genomique Populationnelle
  • Choix d’une option (3 ECTS) parmi 7 proposées, l’UE SIG étant recommandée
  • Biodiversité et Fonctionnement des Ecosystèmes
  • Statistique Bayesienne
  • Phylogénie et Evolution Moléculaire
  • SIG et Analyses Spatiales

Schéma de l’offre de formation du semestre 1 du Master 2 BEEB (UE obligatoires en bleu, optionnelles en rose).

Semestre 2 (S4)

Le semestre 2 est consacré à un stage de longue durée (30 ECTS). Ce stage donne lieu à la rédaction d’un rapport et à une soutenance orale.

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Le stage en entreprise

Le stage, d’une durée de 4 à 6 mois, permet une immersion dans le monde du travail dans le domaine de la gestion environnementale des espaces naturels et urbains. Au cours du premier semestre, chaque étudiant doit réaliser une recherche de stage sur la base d’un cahier des charges établi avec les responsables du M2. Le sujet du stage et le choix de la structure d’accueil (bureau d’études, collectivité, syndicat mixte, conservatoire, laboratoire, etc.) doivent être validés par le Comité de direction.

Organisation et évaluation

L’ensemble des cours et examens se déroule au premier semestre. Chaque UE fait l’objet d’une épreuve écrite, orale ou dossier.

Comité de direction du M2

Comité issu du comité de perfectionnement du Master comprenant 3 chercheurs et enseignants-chercheurs des laboratoires partenaires et représentants des partenaires. Il est chargé de former les jurys en début d’année, d’allouer les rapports des étudiants et d’orienter les candidatures vers les structures d’accueil adéquates.

Jury BEEB

Le jury délibère sur les épreuves de S3 et S4. Chaque étudiant est évalué par trois examinateurs (maître de stage, tuteur universitaire et responsable de la formation). Le lien avec le tuteur est indispensable et doit être consulté régulièrement. Chaque examinateur transmet une note avec un court commentaire, justifiant la notation pour chaque rapport. L’épreuve orale se déroule devant un jury début septembre.

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Modalités d’admission et d’inscriptions

L’admission en M2 est prononcée par une commission d’admission propre au parcours, composée des membres de l’équipe pédagogique. L’admission exige l’obtention d’un diplôme dans le domaine concerné (M1, école d’ingénieur, etc.) et le dépôt d’un dossier complet. Compte tenu de la capacité d’accueil limitée, l’admission dépendra de la qualité du dossier et du projet professionnel. Le candidat doit prendre contact avec le responsable du parcours avant le dépôt du dossier (par téléphone ou visioconférence). En l’absence de prise de contact, le dossier ne sera pas retenu.

Constitution du dossier

Procédure officielle d’inscription et constitution du dossier sur eCandidat. Lien : https://ecandidat.univ-lyon1.fr/

En cas de difficultés avec eCandidat, contacter la scolarité du Département de Biologie (coordonnées publiques non affichées ici).

Tout dossier incomplet sera refusé. Les notes du semestre 2 du M1 doivent être envoyées rapidement au département de Biologie.

Calendrier des inscriptions pour la rentrée 2018 :
Dépôt des dossiers à l’administration : du 21 mai au 18 juin 2021
Réunion du jury d’admission : 29 juin 2021
Transmission de la décision de la commission : 6 juillet 2021
Confirmation de l’inscription : 15 juillet 2021

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Débouchés et insertion professionnelle

L’insertion professionnelle est au cœur de la formation. Elle se concrétise notamment par une formation approfondie à la communication scientifique, à la gestion de projet et à la réalisation d’un stage longue durée.

La formation prépare notamment :

  • aux fonctions de chef de projet dans des actions de valorisation du patrimoine naturel, à la coordination d’études d’impact ou de projets dans le domaine du développement durable et de la gestion des espaces urbains et périurbains, avec diverses possibilités de statut (fonction publique territoriale, libéral, ou associatif),
  • aux thèses CIFRE et à l’entrée dans les écoles doctorales dont le champ couvre l’écologie, la gestion de l’environnement et la biodiversité.

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Devenir professionnel

Pour accéder à l’ensemble des statistiques d’insertion professionnelle, voir les ressources officielles prévues à cet effet.

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Descriptif des Unités d’enseignement

Droit, économie et gouvernance de l’environnement

Cette unité vise à apporter les bases juridiques et socio-économiques de la gestion de l’environnement, avec un volet droit de l’environnement et un volet économie et gouvernance.

Droit de l’environnement (54 h)

Conçu pour un public non juriste afin d’acquérir des compétences juridiques dans des domaines techniques. Inclut les sources du droit (international, européen, national), les principes fondamentaux (pollueur-payeur, prévention, précaution, participation, développement durable, droits des générations futures), le droit de l’eau et de la diversité biologique, les réglementations relatives à l’étude d’impact et à la planification urbanistique, et un atelier de mise en situation.

Gouvernance et Economie de l’environnement (21 h)

Apport sociologique et économique pour traiter les problématiques de valorisation et de représentation de la nature, et introduction à la diversité des approches en diagnostic environnemental.

Equipe pédagogique : Droit de l’environnement – enseignants-chercheurs et avocats; Gouvernance et Economie de l’environnement – chercheurs CNRS.

Bioévaluation et remediation

UE obligatoire visant à étudier le rôle des informations biologiques et écologiques en bioévaluation et en restauration des écosystèmes (9 CM / 9 TP) : fondements des outils de bioévaluation, évaluation des services écosystémiques, méthodes d’ingénierie écologique et cadre socio-économique et technique, étude diagnostique complète d’un écosystème périurbain et propositions de réhabilitation.

Equipe pédagogique : personnel universitaire et chercheurs.

Approches interdisciplinaires en écologie et évolution : transferts à l’application

Objectif : considérer des concepts écologiques clés et les décliner pour une gestion écologique de l’environnement selon les directives européennes. Thématiques : conservation et suivi de population, restauration des écosystèmes côtiers, connectivité et corridors écologiques. Conférences introductives suivies d’interventions de professionnels autour de la valeur de la biodiversité et des modes d’action, gestion des habitats et zonation.

Equipe pédagogique : professionnels et chercheurs internationaux.

Communication scientifique savoir-être et savoir-faire

Former les étudiants à la diffusion, écrite et orale, des résultats de recherche destinés à divers lecteurs (chercheurs, gestionnaires, collectivités). Apprentissage de la structuration et présentation de documents clairs et convaincants, avec attention aux bonnes pratiques scientifiques. Volume prévu : 8 h CM, 10 h TP.

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Equipe pédagogique : enseignants-chercheurs et chercheurs.

Anglais

Enseignement dispensé par le service de langues de l’établissement pour atteindre le niveau B1.

Projet tutoré pour l’insertion professionnelle

Projet individuel ou collectif géré sous contrainte de temps et de moyens, proposé par l’équipe pédagogique, un organisme d’accueil ou les étudiants. Le projet comprend la mise au propre du cahier des charges et un compte rendu écrit et une présentation orale. Un tuteur universitaire et des ressources externes apportent l’appui nécessaire.

Equipe pédagogique : oeuvres pédagogiques dédiées au tutorat.

Système d’information géographique

Initiation à l’organisation et l’analyse de données écologiques avec un SIG (30 h, dont 4 h TP terrain). Contenu en trois volets :

  • Théorie et concepts des SIG, collecte et structuration des données, cartographie
  • Prise en main d’ARCGIS/QGIS et traitements de base (vecteur et raster) avec étude de référence
  • Travail autonome sur des données terrain et une base du parc national concerné

Equipe pédagogique : enseignants et professionnels.

Trajectoires évolutives

En écologie évolutive, comprendre les trajectoires évolutives des espèces et l’évolution des adaptations à travers des approches de modélisation. Objectif : initier les étudiants à ces approches et à l’importance de la variabilité individuelle (CM/TD).

Equipe pédagogique : chercheurs et enseignants-chercheurs.

Modèles statistiques pour la biologie

Relation entre biologie évolutive et écologie, utilisation de R pour démontrer l’implication des statistiques dans l’extraction d’informations, avec des exemples concrets (CM et TD).

Equipe pédagogique : enseignants-chercheurs.

Génomique populationnelle

Former à l’analyse et l’utilisation de données populationnelles à l’échelle des génomes, et aborder le rôle de l’épigénome et des interactions génome-environnement dans l’évolution. Notions clés : reproduction et évolution des génomes, épigénome à l’échelle des populations, écologie et génomique.

Equipe pédagogique : chercheurs et enseignants-chercheurs.

Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes

Comprendre les mécanismes de la dynamique de la biodiversité et son rôle dans le fonctionnement des écosystèmes à différentes échelles spatiales. Champs couverts : mesure et analyse de la biodiversité, liens avec les perturbations et les invasions biologiques, rôle de la biodiversité dans les cycles biogéochimiques, interactions trophiques et traits fonctionnels.

Equipe pédagogique : chercheurs concernés.

Statistique bayésienne

Initiation à l’inférence bayésienne et aux outils techniques. Comprendre les différences avec l’inférence fréquentiste, interpréter l’estimation des paramètres et valider le modèle. Inclut théorie, mise en œuvre avec des outils type BUGS/JAGS et études de cas.

Equipe pédagogique : chercheurs et enseignants-chercheurs.

Phylogénie et Evolution moléculaire

Contenu à venir.

Apolline Gendreau-Lafitte
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