Bioévaluation des écosystèmes et expertise de la biodiversité (BEEB)

Parcours M2

Université Lyon 1

Contacts

Informations de contact disponibles sur le site officiel de l’université. Les coordonnées privées sont supprimées pour respecter la confidentialité.

Préambule

Le M2 parcours BEEB « Bioévaluation des Ecosystèmes et Expertise de la Biodiversité » accueillera sa première promotion dans la version actualisée à la rentrée 2016. Retrouvez ci‑après les éléments essentiels pour découvrir l’offre, son fonctionnement, les modalités d’inscription et les débouchés.

Objectifs de la formation

Ce diplôme vise des ingénieurs conseillers en environnement, spécialisés dans la gestion des espaces protégés et la mise en œuvre des directives européennes (Cadre sur l’eau, Habitat, Oiseaux). L’approche est pluridisciplinaire, mêlant sciences écologiques et sciences humaines. Les missions incluent conception, conseil et suivi de projets, actions de gestion et conservation des espaces naturels, périurbains et urbains à haute valeur patrimoniale, sous des aspects juridiques et scientifiques. Le parcours forme des professionnels intégrant les politiques de développement durable en France et en Europe. Le champ d’action couvre :

  • prévision des impacts d’aménagement et définition de zones à protéger,
  • évaluation de l’efficacité des mesures de protection et de restauration,
  • intégration des critères socio‑économiques et du cadre juridique dans les actions conservatoires,
  • coordonner les études d’impact ou les projets liés au développement durable.

La formation BEEB est associée au M2 EEG du point de vue pédagogique et bénéficie de partenariats importants en gestion de l’environnement, avec des acteurs publics et privés. Ces partenaires jouent un rôle clé dans les stages et le recrutement des étudiants.

Compétences et savoir-faire visés à l’issue de la formation

  • Capacité de synthèse
  • Démarche intégrative
  • Restitution de résultats scientifiques (orale et écrite)
  • Conduite de projet et rédaction de cahier des charges
  • Gestion de l’interface entre scientifiques et gestionnaires
  • Constitution de dossiers techniques
  • Travail en équipe

Originalités et force de la formation M2 BEEB

  • Contributions des équipes de recherche impliquées dans la bioévaluation, la gestion et la restauration des écosystèmes et l’analyse de la biodiversité
  • Pluridisciplinarité assurée par des spécialistes du droit de l’environnement et de la socio‑économie
  • Réseau de professionnels de l’environnement, services de l’État et conservatoires impliqué dans des projets NATURA 2000

Contenu pédagogique et organisation des cours

Semestre 1 (S3)

Des conférences interdisciplinaires sur des thèmes actuels de gestion environnementale (conservation, restauration, connectivité) permettront de combiner compétences en écologie et méthodologie et de mesurer les apports de la pluridisciplinarité (UE AIEE transfert à l’application).

Deux UEs dédiées à l’insertion professionnelle, en partenariat avec le M2 EEG, sont proposées : Communication scientifique et Anglais.

L’UE Projet tuteuré offre la possibilité de mener un projet commandé par un prestataire, en totale autonomie, constituant une vraie mise en situation professionnelle.

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Le choix d’une UE optionnelle complète la formation. Compte tenu de la vocation professionnelle du parcours et de la demande des employeurs, l’UE SIG est fortement recommandée. D’autres UEs telles que Biodiversité et Fonctionnement des écosystèmes ou Modèles statistiques pour la biologie sont également envisageables.

Trajectoires évolutives

  • Modèles statistiques pour la biologie
  • Génomique populationnelle
  • Choix d’une option (3 ECTS) parmi 7 propositions, l’UE SIG étant recommandée
  • Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes
  • Statistique bayésienne
  • Phylogénie et évolution moléculaire
  • SIG et analyses spatiales

Schéma de l’offre de formation du semestre 1

En bleu : UE obligatoires; en rose : optionnelles.

Semestre 2 (S4)

Le deuxième semestre est dédié à un stage de longue durée (30 ECTS). Le stage donne lieu à la rédaction d’un rapport et à une soutenance orale.

Le stage en entreprise

Le stage, d’une durée de 4 à 6 mois, permet une immersion dans le domaine de la gestion environnementale des espaces naturels et urbains. Au cours du premier semestre, chaque étudiant doit identifier son stage selon un cahier des charges établi avec les responsables du M2. Le sujet et le choix de l’organisme d’accueil (bureau d’études, collectivité, syndicat, conservatoire, laboratoire, etc.) doivent être validés par le Comité de direction.

Organisation et évaluation

L’ensemble des cours et des examens se déroule au premier semestre. Chaque UE fait l’objet d’une épreuve écrite, orale ou sous forme de dossier.

Comité de direction du M2

Ce comité, issu du comité de perfectionnement du Master, comprend des chercheurs et enseignants‑chercheurs des laboratoires impliqués et des représentants des partenaires. Il est chargé de former les jurys et d’assigner les rapports des étudiants aux experts, et d’orienter les candidatures vers les structures d’accueil en adéquation avec les projets.

Jury BEEB

Le jury délibère sur les épreuves de S3 et S4. Chaque étudiant est évalué par trois examinateurs notant le rapport écrit (maître de stage, tuteur universitaire et responsable de la formation). Le lien avec le tuteur est indispensable et le tuteur doit être consulté régulièrement. Chaque examinateur transmet une note sur 20 accompagnée d’un court commentaire justifiant la notation. L’épreuve orale a lieu devant un jury composé des maîtres de stages et des tuteurs universitaires en début de septembre.

Modalités d’admission et d’inscriptions

L’admission en M2 est prononcée par une commission d’admission composée des membres de l’équipe pédagogique du parcours. L’entrée en M2 est conditionnée à l’obtention d’un diplôme dans le domaine de l’écologie et au dépôt d’un dossier complet. La capacité d’accueil est limitée et l’admission dépendra de la qualité du dossier et du projet professionnel présenté.

Constitution du dossier

  • Documents d’inscription pédagogique et administrative disponibles via le Département de Biologie (coordonnées consultables en ligne)
  • CV détaillé
  • Lettre de motivation présentant les raisons du choix du parcours, les thèmes scientifiques d’intérêt et le projet de carrière
  • Notes des niveaux L3 et M1 (ou équivalents) et classement des promotions
  • Attestations de stages extra‑universitaires dans le domaine de l’environnement
  • Attestations de participation à des associations liées à l’environnement
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Tout dossier incomplet sera refusé. Les notes du semestre 2 seront à transmettre rapidement au département de Biologie.

Calendrier des inscriptions pour la rentrée 2016

  • Dépôt des dossiers à l’administration (date à définir) – juin 2016
  • Réunion du jury d’admission (à définir) – juillet 2016
  • Confirmation à l’administration (à définir) – juillet 2016

Débouchés et insertion professionnelle

L’insertion professionnelle est au cœur de la formation, renforcée par une maîtrise de la communication scientifique, de la gestion de projet et d’un stage de longue durée.

La formation prépare notamment à :

  • des fonctions de chef de projet dans la valorisation du patrimoine naturel et la coordination d’études d’impact ou de projets de développement durable dans la gestion des espaces urbains et périurbains, avec des statuts variés (fonction publique territoriale, libéral, ou associative)
  • des thèses CIFRE et l’entrée dans les écoles doctorales couvrant l’écologie, la gestion de l’environnement et la biodiversité

Plus d’offres d’emploi sont consultables sur des réseaux et sites professionnels dédiés, notamment des ressources liées à l’environnement et à la biodiversité.

Suivez le M2 sur Facebook

Bientôt disponibles les informations officielles sur la page Facebook du Master BEEB.

Devenir professionnel

Pour accéder à des statistiques d’insertion professionnelle, des ressources sont disponibles via les canaux officiels de l’établissement et les publications dédiées à chaque promotion.

Descriptif des Unités d’enseignement

Droit, économie et gouvernance de l’environnement

UE destinée au parcours BEEB visant à apporter les bases juridiques et socio‑économiques de la gestion de l’environnement, comprenant un volet droit de l’environnement et un volet économie et gouvernance (57 h TP / 18 h CM).

Droit de l’environnement

Formation adaptée à un public non juriste, avec des notions juridiques fondamentales et des notions ciblées. Axes : sources du droit, principes du droit de l’environnement, droit de l’eau, droit de la diversité biologique, réglementations liées à l’étude d’impact et à l’urbanisme, atelier pratique.

Gouvernance et économie de l’environnement

Formation intégrant sociologie et économie pour traiter les problématiques de valorisation et de représentation de la nature, et l’initiation à la diversité des approches du diagnostic environnemental des territoires.

Bioévaluation et remediation

UE obligatoire sur le rôle des informations biologiques et écologiques en bioévaluation et restauration des écosystèmes (9 TP / 9 CM). Thèmes : fondements des outils de bioévaluation, état écologique et état de référence, services écosystémiques, ingénierie écologique et cadres socio‑économiques et techniques, études diagnostiques et propositions de réhabilitation.

Approches interdisciplinaires en écologie et évolution : transferts à l’application

UE axée sur l’application de concepts écologiques clés pour la gestion écologique, abordant des thèmes comme la conservation et le suivi de populations, la restauration des écosystèmes côtiers et la connectivité. Interventions de professionnels de l’environnement sur la valeur de la biodiversité, la gestion des habitats et la zonation des espaces protégés.

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Communication scientifique, savoir‑être et savoir‑faire

Objectif: outiller les étudiants pour diffuser leurs résultats, à l’écrit comme à l’oral, à destination de différents lecteurs et auditoires. Apprentissage de la structuration et de la présentation de documents clairs et convaincants, en respectant les bonnes pratiques scientifiques et les destinataires visés.

Anglais

Formation dispensée par le service dédié pour atteindre le niveau B1.

Projet tutoré pour l insertion professionnelle

Projet tutoré individuel ou collectif: gestion sous contraintes de temps et de moyens, proposé par l’équipe pédagogique, un organisme d’accueil ou les étudiants eux‑mêmes. Objectifs: développer l’esprit d’équipe et livrer un compte rendu écrit et une présentation orale. Un tuteur universitaire et des ressources externes apportent l’appui nécessaire.

SIG et analyses spatiales

Contenu spécifique à venir.

Trajectoires évolutives

Objectifs en écologie évolutive pour comprendre les trajectoires évolutives des espèces et analyser les effets de la variabilité individuelle sur l’évolution et l’écologie, via des approches de modélisation et des outils tels que les IPM et l’analyse de la personnalité animale, etc.

Modèles statistiques pour la biologie

Objectifs: décrire la variabilité dans les systèmes naturels et comprendre les facteurs explicatifs. Formation orientée sur l’utilisation du logiciel R pour des modèles descriptifs, des modèles probabilistes et la sélection de covariables explicatives.

Génomique populationnelle

Formation axée sur l’analyse et l’usage de données populationnelles à l’échelle des génomes, et l’examen du rôle de l’épigénome et des interactions génome‑environnement dans l’évolution des espèces. Notions clés abordées: reproduction et évolution des génomes, épigénome à l’échelle des populations, génomique et écologie.

Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes

Compréhension des mécanismes de la dynamique de la biodiversité et du rôle de la biodiversité dans le fonctionnement des écosystèmes, à travers la mesure et l’analyse de la biodiversité à différents niveaux hiérarchiques et les liens entre biodiversité, perturbations et dynamique des écosystèmes, y compris l’impact du changement climatique et les invasions biologiques. Décryptage du rôle de la biodiversité dans les cycles biogéochimiques, les groupes fonctionnels, les interactions trophiques et les traits fonctionnels dans les communautés.

Statistique bayésienne

Initiation à l’inférence bayésienne et outils pratiques, distinction entre inférence bayésienne et fréquentiste, estimation des paramètres et validation des modèles, avec utilisation d’heures et d’outils tels que BUGS et JAGS.

Phylogénie et évolution moléculaire

Contenu à venir.

Apolline Gendreau-Lafitte
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