Bioévaluation des écosystèmes et expertise de la biodiversité (BEEB)

Parcours M2

Ce master 2, parcours BEEB, s’inscrit dans une logique de renouvellement et a accueilli sa première promotion dans sa version actuelle dès la rentrée 2016. Vous trouverez ci-dessous les informations essentielles pour découvrir l’offre, son fonctionnement, les modalités d’inscription et les débouchés.

Objectifs de la formation

Cette formation vise des ingénieurs-conseillers en environnement, spécialistes de la gestion des espaces protégés et de la mise en œuvre des directives européennes (Cadre sur l’eau, Habitat, Oiseaux) dans une approche pluridisciplinaire associant sciences écologiques et sciences humaines. Les métiers visés couvrent la conception, le conseil et le pilotage de projets, la mise en œuvre d’actions de gestion et de conservation des espaces naturels périurbains et urbains à haute valeur patrimoniale, en tenant compte des aspects juridiques et scientifiques. L’objectif est de former des professionnels susceptibles d’intégrer le processus de mise en œuvre des politiques de développement durable en France et en Europe. Leur champ d’action inclut :

  • la prévision des impacts d’aménagement et la définition de zones à protéger,
  • l’évaluation de l’efficacité des mesures de protection et de restauration,
  • l’intégration des critères socio‑économiques et du cadre juridique dans les actions conservatoires,
  • la coordination d’études d’impact ou de projets liés au développement durable.

La formation BEEB s’appuie sur le M2 EEG au niveau pédagogique et bénéficie de nombreux partenaires en gestion de l’environnement ou issus des collectivités locales. Ces partenaires jouent un rôle central dans l’offre de stages et le recrutement des étudiants.

Compétences et savoir-faire visés

  • capacité de synthèse
  • démarche intégrative
  • restitution de résultats scientifiques (oral et écrit)
  • conduite de projet et rédaction de cahier des charges
  • gestion de l’interface entre chercheurs et gestionnaires
  • constitution de dossiers techniques
  • travail en équipe

Originalités et forces du diplôme

  • implication des équipes de recherche acts dans la bioévaluation, la gestion et la restauration des écosystèmes et l’analyse de la biodiversité
  • approche pluridisciplinaire réunissant droit de l’environnement et socio‑économie
  • réseau de professionnels de l’environnement (bureaux d’études), services de l’État et conservatoires (projets NATURA 2000)

Contenu pédagogique et organisation des cours

Semestre 1 (S3)

Des conférences interdisciplinaires sur des thématiques actuelles de gestion environnementale (conservation, restauration, connectivité) permettront aux étudiants de croiser leurs compétences en écologie et en méthodologie, et d’évaluer les apports de la pluridisciplinarité. Deux UEs dédiées à l’insertion professionnelle et partagées avec le M2 EEG sont proposées (Communication scientifique et Anglais). L’UE Projet tutoré offre la possibilité de mener un projet commandé par un prestataire, en condition professionnelle réelle. Le choix d’une UE optionnelle complète la formation, avec une forte recommandation pour l’UE SIG. D’autres UEs comme Biodiversité et Fonctionnement des écosystèmes ou Modèles statistiques pour la biologie sont envisageables.

  • Trajectoires évolutives
  • Modèles statistiques pour la biologie
  • Genomique populationnelle
  • Choix d’une option (3 ECTS) parmi 7 proposées, l’UE SIG étant fortement recommandée
  • Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes
  • Statistique bayésienne
  • Phylogénie et évolution moléculaire
  • SIG et analyses spatiales
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Schéma de l’offre de formation du semestre 1 du Master 2 BEEB : les UE obligatoires sont indiquées en bleu et les options en rose.

Semestre 2 (S4)

Le second semestre est consacré à un stage de longue durée (30 ECTS). Ce stage donne lieu à la rédaction d’un rapport et à une soutenance orale.

Le stage en entreprise

Le stage, d’une durée de 4 à 6 mois, permet une immersion dans le monde du travail en gestion environnementale des espaces naturels et urbains. Au cours du premier semestre, chaque étudiant identifie son stage sur la base d’un cahier des charges défini avec les responsables du parcours. Le sujet du stage et le choix de la structure d’accueil (bureau d’études, collectivité, syndicat mixte, conservatoire, laboratoire, etc.) doivent être validés par le Comité de direction.

Organisation et évaluation

L’ensemble des cours et examens se déroule au semestre 1. Chaque UE donne lieu à une épreuve écrite, orale ou dossier.

Modalités d’admission et d’inscriptions

L’admission est délivrée par une commission d’admission spécifique au parcours, composée des membres de l’équipe pédagogique. L’entrée en M2 dépend de l’obtention d’un diplôme dans le domaine de l’écologie et du dépôt d’un dossier complet. La capacité d’accueil étant limitée, l’admission dépendra de la qualité des dossiers et du projet professionnel. Le candidat doit contacter le responsable du parcours avant de déposer le dossier. Sans prise de contact, le dossier ne sera pas retenu.

Constitution du dossier

Procédure officielle d’inscription et constitution du dossier sur eCandidat : https://ecandidat.univ-lyon1.fr/

En cas de difficultés liées à eCandidat, contacter la scolarité du Département de Biologie : un contact est fourni via la procédure d’inscription. Tout dossier incomplet sera refusé; les notes du semestre 2 du M1 devront être envoyées rapidement au département de Biologie.

Calendrier des inscriptions

Dates indicatives pour la rentrée concernée : dépôt des dossiers, 21 mai au 18 juin; réunion d’admission; fin juin; transmission de la décision; début juillet; confirmation d’inscription.

Débouchés et insertion professionnelle

L’insertion professionnelle est au cœur de la formation et se traduit par une formation approfondie en communication scientifique, gestion de projet et réalisation d’un stage de longue durée. La formation prépare notamment à :

  • des postes de chef de projet dans des actions de valorisation du patrimoine naturel, la coordination d’études d’impact ou de projets liés au développement durable et à la gestion des espaces urbains et périurbains, avec des possibilités de statut de fonctionnaire, libéral ou associatif
  • des thèses CIFRE et des entrées en écoles doctorales dans les domaines de l’écologie, de la gestion de l’environnement et de la biodiversité
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Des offres d’emploi sont répertoriées via divers réseaux et sites spécialisés dans le domaine.

Suivez le M2 sur Facebook

Des informations seront prochainement publiées sur le compte Facebook du Master BEEB.

Devenir professionnel

Pour accéder à l’ensemble des statistiques d’insertion professionnelle, consultez la page dédiée.

Descriptif des Unités d’enseignement

Droit, économie et gouvernance de l’environnement

Cette unité vise à apporter les bases juridiques et socio‑économiques nécessaires à la gestion de l’environnement, avec un volet droit et un volet économie/gouvernance.

  • Droit de l’environnement (54 h) : cours conçu pour un public non juriste et couvrant les sources du droit, les grands principes (pollueur‑payeur, prévention, précaution, participation, développement durable, droits des générations futures), le droit de l’eau, le droit de la diversité biologique, les réglementations liées à l’étude d’impact et à l’urbanisme, et un atelier pratique.
  • Gouvernance et économie de l’environnement (21 h) : apport de sociologie et d’économie pour traiter les questions de valorisation et de représentation de la nature, et introduction à la diversité des approches en diagnostic environnemental.

BIOEVALUATION ET REMEDIATION

Cette unité est obligatoire pour le parcours et porte sur le rôle des informations biologiques et écologiques en bioévaluation et en restauration des écosystèmes (9 CM / 9 TP).

  • Fondements des outils de bioévaluation et services écosystémiques
  • Méthodes d’ingénierie écologique et cadres socio‑économiques et techniques de mise en œuvre
  • Étude diagnostique complète d’un écosystème périurbain et propositions de réhabilitation

Approches interdisciplinaires en écologie et évolution : transferts à l’application

L’objectif est d’examiner quelques concepts écologiques clés et leur mise en œuvre pour une gestion écologique de l’environnement dans le cadre des Directives Européennes. Thématiques abordées :

  • Conservation et suivi des populations
  • Restauration des écosystèmes côtiers
  • Connectivité et corridors écologiques

Ces thématiques font l’objet de conférences d’ouverture, suivies de contributions de professionnels sur la valeur de la biodiversité, la gestion des habitats et la zonation des espaces à protéger.

Communication scientifique – savoir-être et savoir-faire

Objectif : transmettre les compétences nécessaires pour diffuser et présenter clairement des résultats de recherche à divers publics (chercheurs, gestionnaires, élus). Le travail porte sur la structuration et la présentation de documents clairs et convaincants, dans le respect des bonnes pratiques scientifiques (8 h CM, 10 h TD).

Anglais

Enseignement assuré par le service de langues de l’université pour atteindre le niveau B1.

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Projet tutoré pour l’insertion professionnelle

Projet individuel ou collectif géré sous contrainte de temps et de moyens, avec mise au propre du cahier des charges et restitution écrite et orale. Un tuteur universitaire et des professionnels apportent un soutien dans leur domaine de compétence.

Système d’information géographique

Initiation à l’organisation et l’analyse de données écologiques avec un SIG (30 h dont 4 h de TP terrain), avec trois volets :

  • Présentation théorique des méthodes et concepts
  • Prise en main d’ARCGIS/QGIS et traitements de base (vecteur et raster)
  • Travail autonome sur des données terrain et sur une base du parc de référence

Trajectoires évolutives

Comprendre les trajectoires évolutives des espèces et les effets de la variabilité individuelle à travers des approches de modélisation, notamment en écologie comportementale. L’unité introduit ces méthodes et sensibilise à l’importance de la variabilité individuelle (CM et TD).

Modèles statistiques pour la biologie

Approche des objectifs communs entre biologie évolutive et écologie : décrire la variabilité et en comprendre les facteurs. Travail sur des données réelles avec le logiciel R, incluant des modèles descriptifs, des modèles probabilistes et des critères d’information pour la sélection de covariables.

Génomique populationnelle

Formation à l’analyse et à l’usage de données à l’échelle des génomes, abordant les évolutions liées à la reproduction, l’épigénome et les interactions génome x environnement (9 h CM, 9 h TD).

Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes

Compréhension des mécanismes de dynamique de la biodiversité et du rôle de la biodiversité dans les écosystèmes, à différentes échelles et en lien avec les perturbations climatiques et les invasions biologiques. Thèmes : mesure et analyse de la biodiversité, liens avec les cycles biogéochimiques, groupes fonctionnels et interactions trophiques.

Statistique bayésienne

Initiation à l’inférence bayésienne, comparaison avec l’approche fréquentiste, interprétation des paramètres et validation des modèles. Mise en œuvre avec des outils type BUGS et JAGS, à travers des cas pratiques.

Phylogénie et évolution moléculaire

Contenu à préciser à ce jour.

Apolline Gendreau-Lafitte
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